L’informatique et la bioinformatique au service d’une start-up productrice de biopesticides
Les bio-pesticides sont des organismes vivants ou des produits issus de ces derniers capables de tuer ou inhiber le développement ou l’activité de prédateurs des plantes. Ces produits sont notamment destinés à remplacer des pesticides chimiques dont les effets néfastes sur la santé humaine et l’environnement ont été largement démontrés. Un des axes de recherche du laboratoire ProBioGEM est la recherche de nouvelles molécules synthétisées par un mécanisme de synthèse particulier, la synthèse de peptides par la voie non ribosomique et susceptibles d’être de nouveaux bio-pesticides. Le Laboratoire développe également des recherches pour optimiser la production de ces molécules et leur donner ainsi un avenir industriel. Dans le cadre de ces recherches, le laboratoire ProBioGEM a développé un projet de start-up, Lipofabrik, et différentes collaborations nationales et internationales (projet européen PHYTOBIO). Des collaborations étroites ont également été développées dans le domaine de la bio-informatique avec deux équipes du LIFL. D’une part, différents outils bioinformatiques ont été mis au point pour la recherche des nouvelles molécules en collaboration avec l’équipe de Maude Pupin (banque de données NORINE des peptides d’origine non-ribosomique, logiciel de comparaison de structure en deux dimensions…). D’autre part une collaboration avec l’équipe de Joachim Niehren a été mise en place récemment pour développer une approche de biologie synthétique appliquée à la synthèse de ces peptides afin de maitriser les voies métaboliques de synthèse de ces molécules.
Intervenant : Philippe Jacques, ProBioGEM
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